藤野先生是一位對魯迅很用影響力的人，他是一個很友善很和藹的人。作為日本人，他并沒有對來自弱國的魯迅加以嘲諷和嘲笑，反而是加以細心關照，對他的講義都要用紅筆認認真真的批改一番，連語法錯誤都要批改出來，甚至講義上的一個圖里的一根血管移了一點點的位置都要跟學生講明。他對魯迅十分關心，以至于中國人的迷信，藤野先生也要為魯迅思考。總之就像是很熟悉的朋友差不多，在與魯迅離別的時候還送了照片，背后還寫了惜別兩個字。可見他對魯迅的感情十分濃厚。“每當夜間疲倦，正想偷懶時，仰面在燈光中瞥見他黑瘦的面貌，似乎正要說出抑揚頓挫的話來，便使我忽又良心發現，而且增加勇氣了，于是點上一支煙，在繼續寫些為“正人君子”之流所深惡痛疾的文字。”看這段話，可看出藤野先生對于魯迅來說，也是一名很好的朋友，也可看出藤野先生對魯迅的影響有多大。在魯迅過世后，藤野先生還寫了一篇《謹憶周樹人君》來紀念魯迅。
《藤野先生》回憶魯迅在仙臺留學時期的生活，記敘了魯迅與藤野先生的相識、相處，離別的過程和對他的懷念。
魯迅初到東京時，看到的是清國留學生在飽含中國人的恥辱的上野公園的櫻花樹下的身影，聽到的是留學生們傍晚學跳舞的喧鬧。這讓魯迅甚為厭惡，也正是這樣，他去了仙臺，在那與藤野先生相識。
藤野先生的衣著模糊，他為魯迅添改講義，他就正解剖圖，他關心解剖實習，他了解中國女生裹腳。
在這一個個片斷中，我看到了那個對學生要求嚴格的藤野先生，那個對魯迅關愛有加，毫無民族偏見的藤野先生，那個對科學嚴謹求實的藤野先生。